ChIP-seq是研究組蛋白修飾和轉錄因子在基因組上結合 位置的有效技術手段,然而,由于其通常需要百萬級別的 細胞量,且需要經過甲醛交聯、超聲物理性打斷等步驟, 使得實驗過程較復雜,數據背景噪音高且可重復性較差, 限制了數據結果的準確性和稀少樣品的可應用性。
為了克服ChIP-seq的缺點,研究者開發了CUT&Tag (Cleavage Under Targets and Tagmentation)技術,該 技術運用連接有刀豆蛋白的磁珠結合細胞膜或細胞核, 通過抗體將Protein A-Tn5轉座酶融合蛋白帶到目標蛋白 附近進行染色質切割,并釋放到細胞外,由于未對細胞核 和染色質進行物理性的破壞,整個操作過程相當“溫和”, 因此CUT&Tag的背景噪音數據非常少,對起始細胞量的 要求大幅減少,且數據可重復性好。