核小體是真核細胞染色質的基本結構單位,由DNA和組蛋白構成,而沒有核小體結合的DNA區域容易被核酸酶消 化,也易于與調控蛋白相結合,這些開放的DNA序列則可以使其下游的基因處于活躍表達的狀態。細胞通過改變 DNA與組蛋白的結合位置從而調控基因的表達。因此,獲得處于開放狀態的DNA序列可用于研究基因表達的調控 機制,是表觀遺傳學研究的熱點。
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)是使用高通量測序 對Tn5轉座酶易接近性染色質區域進行測序分析的一種表觀遺傳學研究技術,可獲得在特定時空下全基因組染色 質開放區域,挖掘開放位點的潛在結合轉錄因子,結合基因表達水平數據,發現關鍵轉錄因子。