Small RNA主要包含miRNA、piRNA、snoRNA、tsRNA等RNA分子，其參與基因表達與調控、RNA的加工與剪切、蛋白質 翻譯、配子發生等重要生物學過程，是生命活動中不可少的調控因子。Small RNA測序可針對樣本中的miRNA、 siRNA、piRNA等展開全面分析，既能鑒定已知sRNA、也能預測新的sRNA并預測sRNA的靶基因。
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