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再獲強援,看菲沙基因如何打造高品質水產基因組服務

發布時間:2019-3-22 9:15:58閱讀次數: 分享到:

        中國是世界前列的漁業和水產養殖國家,豐富的水產資源是我國糧食的重要構成部分也是我國經濟的巨大來源之一。開展水產基因組研究,可以幫助我們選育出更優良的水產生物品種,具有基礎性的科學意義。同時,深入挖掘基因組信息,也將為水生生物基因組演化、性別決定及分化機制等理論研究奠定重要基礎。


       菲沙基因深耕水產研究領域多年,集成了先進的三代測序技術平臺和三維技術平臺,從數據產出到生物學問題挖掘,打造了水產基因組整體解決方案,已與眾多行業專家合作并發表多篇高水平論文。2019年伊始,為了提供更加專業、準確的服務,菲沙基因特別聘任中國科學院水生生物研究所何舜平研究員加入公司。


       3月15日,菲沙基因舉行了2019年特聘專家聘任儀式。武漢國家生物產業基地建設管理辦公室常務副主任錢德平出席本次會議并進行致辭,他對何舜平研究員的到來表示熱烈歡迎,并對菲沙基因聘任何舜平研究員表示由衷的祝賀。儀式上,錢德平副主任與菲沙基因總經理陳東生先生一同為何舜平研究員頒發了特聘專家證書,聘任何舜平研究員為菲沙基因“水產基因組科學家”。何舜平教授對公司的成果與技術表示贊賞,他希望能夠與菲沙基因聯合開展更多魚類基因組研究,為我國水產事業做出更大的貢獻。


何舜平研究院簡介

        何舜平,男,1962年12月2日出生,法國國家自然歷史博物館理學博士。2003年國家杰出青年基金獲得者、中國科學院水生生物標本館館長、中國科學院標本館網絡信息系統水生生物(海洋)中心主任。中國中科學院水生生物研究所、深??茖W與技術研究所,中國科學院大學動物進化與遺傳前沿交叉卓越創新中心研究員。博士研究生導師。中國動物學會理事,湖北省暨武漢動物學會理事兼副秘書長。湖北省科協第六屆委員;任《中國動物志》編委,《生物多樣性》學報編委,《水生生物學報》編委。先后主持和承擔歐盟項目、國家自然科學青年基金、重點基金、杰出青年基金、國家863課題、973專題。并任中國科學院創新方向性項目首席科學家。


菲沙水產項目經驗

       菲沙基因擁有豐富的水產基因組項目經驗,目前已完成多個物種的基因組項目研究,涉及鯰形目、鱸形目、鯉形目、中腹足目、柄眼目等。PacBio Sequel新版3.0試劑數據產出量,平均Subread N50達到25Kb,結合Hi-C技術輕松打造染色體級別高質量基因組。



水產文章成果

        2018年9月,華中農業大學研究團隊公布黃顙魚的基因組,菲沙基因結合PacBio 和Hi-C技術提供了染色體水平的基因組組裝服務。同月,浙江海洋大學研究團隊聯合菲沙基因基于PacBio Sequel對中國鱚魚進行三代測序和組裝,首次解析了中國鱚魚全基因組序列信息。2019年2月,中科院海洋研究所團隊發表條石鯛基因組,采用菲沙三代和三維技術平臺構建染色體水平參考基因組,深入挖掘條石鯛的性別決定機制。



        砥礪前行,不忘初心。菲沙基因愿意為水產領域研究者提供優質的三代測序組裝和三維基因組服務,共同完成更多水產基因組研究,探索水產科學的神奇和奧秘,期待與您同行!


參考文獻:

1、Gong Gaorui,Dan Cheng,Xiao Shijun et al. Chromosomal-level assembly of yellow catfish genome using third-generation DNA sequencing and Hi-C analysis.[J] .Gigascience, 2018, 7.

2、Xu Shengyong,Xiao Shijun,Zhu Shilin et al. A draft genome assembly of the Chinese sillago (Sillago sinica), the first reference genome for Sillaginidae fishes.[J] .Gigascience, 2018, 7: undefined.

3、Xiao Yongshuang,Xiao Zhizhong,Ma Daoyuan et al. Genome sequence of the barred knifejaw Oplegnathus fasciatus (Temminck & Schlegel, 1844): the first chromosome-level draft genome in the family Oplegnathidae.[J] .Gigascience, 2019, 8.









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