基于Illumina及其他二代測序平臺組裝得到的細菌基因組往往會存在不少“Gap”,而PacBio和Nanopore測序具有超長讀長無GC偏好性的優勢,能輕松覆蓋微生物基因組中重復序列和異常GC含量的復雜區域,使細菌完成圖成為可能。精確組裝的細菌完成圖,可以獲知待測菌株的基因及相關調控信息,為研究該菌株特有的生物學特征(致病機制,共生機制,獨有的代謝機制)提供分子生物學基礎;通過比較基因組分析,為研究菌株種內及種間的功能差異、進化關系提供理論指導。
技術優勢
超長讀長:平均讀長可達到20 ~30Kb;
單分子實時測序:測序過程無需擴增,不會人為的引入突變;覆蓋均勻,無GC偏好性;
準確率高:通過reads的自我矯正,30X以上準確率能夠達到99.999%(Q50);
堿基修飾檢測:可直接檢測6mA和4mC堿基修飾,應用于表觀遺傳學研究應用方向。
(1)醫學健康領域:鑒定致病相關基因、開發和研究疫苗、開發新型抗生素等;
(2)食品科學領域:酸奶發酵,找到目標菌株生產特定代謝產物的核心基因;
(3)生物能源:產氫氣甲烷菌,纖維素發酵等,研究特定功能的菌株。
技術路線
技術參數