宏基因組學（Metagenomics），也稱元基因組學，利用三代PacBio高通量測序平臺以特定環下微生物群體基因組為研究對象，在分析微生物多樣性、種群結構、進化關系的基礎上，可進一步探究微生物群體功能活性、相互協作關系及與環境之間的關系，發掘潛在的生物學意義。與二代測序方法相比，三代宏基因組采用PacBio SMRT測序的長讀長可以輕松覆蓋基因區間或基因特異性區域，減少部分拼接錯誤，更真實反應菌群的復雜組成，有效提高微生物群落鑒定的分辨率，為深入功能研究奠定完美基礎。
技術優勢
通過對PacBio原始錯誤率的矯正，可以得到高質量CCS Reads，最低準確率達到99%以上，從而較完整地覆蓋大多數微生物基因或基因的特異性區域，無須組裝即可進行菌群組成、功能基因注釋和代謝通路分析。
基于高質量CCS reads的三代組裝策略，增加了來自不同微生物的reads的特異性，有效避免了不同個體reads之間的交叉組裝，精確還原環境中微生物組成和功能基因信息，實現對菌群數據的深度挖掘。
應用方向
（1）醫學領域：代謝病、腫瘤癌癥等；
（2）畜牧領域：腸道、瘤胃（如產甲烷菌類群）與動物健康/營養消化研究等；
（3）農業領域：根際微生物與植物互作、農業耕作/施肥處理與土壤微生物群落等；
（4）環境領域：霧霾處理、污水治理、石油降解、酸性礦水處理及海洋環境等；
（5）生物能源：特殊功能的菌株、基因挖掘、工程菌的開發；
（6）特殊極端環境：極端環境條件下的微生物類群研究。
技術路線
技術參數
微信公眾號
027-87224696
|
marketing@frasergen.com
|
