三代平臺的PacBio Sequel的平均讀長為8-12Kb，16S rDNA長度大約為1500bp左右，該平臺可以成功測序獲得16S/18S/ITS的全長序列，獲得全部變異區域序列信息，不僅能提高物種鑒定的分辨率，還能提高樣本中微生物組成鑒定的精確度，從而能更加真實的還原樣本中微生物的群落結構。
PacBio SMRT測序的長讀長可以減少部分拼接錯誤，有效提高微生物群落鑒定的分辨率。
分析優勢
高通量--能同時分析群落中所有的微生物；
高數據質量--采用PacBio的CCS模式，對序列自我矯正，數據一致性準確率高；
高分辨率--分析16 S rDNA全長，分類精準到種。
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