基因組De novo,又稱為基因組從頭測序,就是對某一物種進行全基因組測序,然后進行拼裝,從而得到該物種的全基因組序列,為后續功能基因挖掘、調控代謝網絡構建、物種進化分析等奠定基礎?;诔L讀長、無GC偏好性、測序準確性高等特點,PacBio +Hi-C已成為動植物基因組組裝的首選技術,組裝的Contig N50已達上百M,且已構建了多個物種的基因組完成圖。
技術路線:
菲沙優勢
穩定的數據產出:PacBio CLR測序平均產出140Gb,最高達到220Gb;CCS測序平均產出達到350Gb,HiFi平均產出達到20Gb,最高達到38Gb。
豐富的項目經驗:累計完成近千例基因組de novo項目,涵蓋各種動植物樣本類型?;谧钚碌腍iFi組裝,80%的物種contig N50大于5M,50%的物種contig N50大于10M,最高達到105M。
豐碩的合作成果:基因組項目文章接近100篇,累計影響因子超過600+,包括多篇Cell、Nature、Molecular Plant 、Cell Discovery、PBJ、NC等。
菲沙HiFi組裝經驗